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华大基因公布“粮食杀手”草地贪夜蛾染色体级别基因组|必一运动

作者:必一运动·(B-Sports)官方网站    发布时间:2024-10-07    浏览量:
本文摘要:自今年年初以来,一只飞蛾的迁移引发了国内农业部门高度紧绷。

自今年年初以来,一只飞蛾的迁移引发了国内农业部门高度紧绷。6月4日凌晨,农业农村部公布《关于作好草地恶夜蛾应急预防用药有关工作的通报》表明,草地恶夜蛾2019年1月由东南亚入侵我国云南、广西,目前已在18个省(区、市)找到,严重威胁我国农业及粮食生产安全性。6月18日,华大基因公布消息称之为,深圳华大生命科学研究院和云南农业大学联合联合,牵头中国科学院动物研究所、广东省农科院、青岛农业大学等多个单位联合正式成立研究小组,对侵略中国的草地恶夜蛾展开仅有基因组测序研究,并于近日已完成了基因组建构,全球首次发布了草地恶夜蛾的高质量染色体水平的基因组。

华大基因方面回应,研究组目前正在积极开展针对草地恶夜蛾的更进一步研究,还包括更进一步的抗农药分子机制研究等,同时研究组也期望同国内更加多涉及的科研院所更进一步积极开展合作,充份考古、利用基因组数据,推展草地恶夜蛾的科学预防,提升预防效率,减少其有可能导致的危害。据理解,草地恶夜蛾是联合国粮农组织全球预警的跨国界迁飞性农业根本性害虫,早已对全球近100个国家和地区造成了农作物危害。2019年1月,该物种由东南亚入侵我国云南、广西,目前已在18个省(区、市)被找到,覆盖面积我国200余万亩粮食产区。

此外,草地恶夜蛾交配能力是一般害虫的25倍,且迁入能力极强,成年的草地恶夜蛾一晚能飞行中100公里,再加季风因素对其迁入速度的助推,当前早已在全国构成了快速增长拓展之势。同时,由于在当前的预防过程中找到,草地恶夜蛾有显著的抗药性,而我国目前还没预防该害虫的注册农药,因此草地恶夜蛾已对我国当前的农业及粮食生产安全性造成了严重威胁。我们亟须通过还包括基因组学在内的前沿科学研究,加剧对该物种的了解,从而寻找根源上预防该侵略物种的关键路径。

今年5月,针对草地恶夜蛾的很快发展态势,国内多个单位联合正式成立研究小组,迅速开展了样本收集和基因测序工作。6月13日,新京报记者从农业农村部了解到,农业农村部开会全国草地恶夜蛾防控工作前进实施视频会议。

农业农村部部长韩长赋在会上特别强调,各级农业农村部门要把防控草地恶夜蛾作为当前农业农村工作的大事要事急事来捉,全面监测预警,及时有效地处理,保证草地恶夜蛾不大规模迁飞、不大面积连片成灾,极力输掉草地恶夜蛾防控攻坚战,全力确保粮食和农业生产安全性。基于华大集团旗下华大智造自律研发的基因测序仪(MGISEQ2000),研究组在取得样品之后4天内已完成了单管宽片段仅有基因组测序(stLFR技术)以及染色体构象捕捉测序(HiC),并在两周内已完成了数据分析,已完成全球首个草地恶夜蛾染色体级别的基因组装配,无论在基因组完整性还是基因集的完整性上,皆多达了当前有数成果。同期已完成仅有基因组测序的有采自云南和广东的草地恶夜蛾各两只,发布的数据还包括了一雌一雄两只蛾的原始基因组数据,整体数据量多达了1.5 Tb。虽然牵头研究组制定的整体研究计划还在更进一步积极开展中,目前在基因组测序方面获得的进展早已为该害虫的预防工作获取了一定的可糅合信息。

在建构的草地恶夜蛾基因组上,研究团队在该物种的12516个基因家族找到了细胞色素p450和谷胱甘肽巯基转移酶两个基因家族相当严重扩展,其中细胞色素p450基因家族与止痛功能密切相关,推断主要掌控其高度杂食性,而谷胱甘肽巯基转移酶基因家族与抗药性密切相关,推断主要驱动其农药抗性。


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